嵊州市中医院中医妇科为绍兴市第三批临床医学重点学科建设单位，嵊州市第一批临床医学重点学科，为集中医中药、中西医结合、中医与现代科技相结合等诊疗手段为一体的学科。设有中医妇科、西医妇科、不孕症专病门诊、计划生育指导门诊。
设有妇科门诊及住院病区，共有医生9人，其中中医5人，西医4人。主任中医师1人，副主任 医师1人。硕士学位2人，研究生在读4人。
融中西医妇科为一体是市中医院妇科最主要的特点之一，即：将传统中医妇科的望闻问切、辨证施治与现代妇科的各种先进诊疗手段相结合，在妇科各种疾病的诊疗中方法独特，疗效显著，以达到标本兼治的目的。在治疗各种疾病的过程中，充分运用中药标本兼治的手法，一方面配以中药，由内而外进行治疗，另外又保留了中药灌肠、耳穴贴压、热袋热敷，使药物以最少剂量发挥其最佳的作用，另一方面，又运用西医妇科检查比较直观的优势，提高了妇科疾病的诊断率，弥补传统中医的不足，然后再对症下药，往往能起到非常好的效果。中西医结合、中西药合用等方法既提高了妇科各种疾病的疗效，又减少了单一方法治疗带来的不良反应。
市中医院妇科住院病房，主要是针对急性盆腔炎、慢性盆腔炎急性发作、妊娠剧吐、宫外孕保守治疗、习惯性流产的保胎治疗等方面开展业务，在治疗过程中，均充分运用了传统中医的特色治疗，又运用先进的西医疗法，使中西医多种治疗方法有机地结合在一起，明显提高了疗效，缩短了疗程，减少不良反应，尤对宫外孕未破之保守治疗中西药并进，其杀胚及包块消除的速度均明显优于单一方法治疗，并且成功率高。与此同时，中医院妇科还开展各种计划生育手术、妇科腹部手术，如子宫切除、卵巢肿瘤切除等，术后适时辩证选用中药或中成药治疗，使病人恢复加快，后遗症减少。
不孕不育问题一直是一个令许多家庭蒙上阴影的难题，为了攻克这个难题，中医院妇科开始着手进行试管婴儿研究，并取得了新突破。在浙大医学院附属妇产科医院有关教授的指导下，中医院开展了人工受精、试管婴儿前期准备工作，后期又运用中西医保胎服务，使不孕不育家庭成功怀孕，并顺利产下健康婴儿。该项目自开展以来，已解除了许多不孕不育患者的烦恼。
在发展过程中，妇科配置了先进的医疗设备，如集微波凝固和照射功能于一体的MTC—4型妇科微波治疗仪，对宫颈糜烂、阴道炎、盆腔炎、外阴与阴道等外的各种赘生物清除等有独特的疗效，尤其是宫颈糜烂，经局部微波凝固加中药外敷，使创面愈合明显加快，疗程大为缩短，阴道流液和流血等症状明显减少，极大地方便了患者的工作和生活。
在中医院妇科在大踏步发展中取得很大的成绩，其中由妇科主任、主任中医师黄亚君主持的科研课题“1125例宫颈糜烂患者CT、UU、HPV16，18感染的调查分析”已通过了浙江大学医学院等单位专家组成的评审委员会的评审，并认为该课题研究成果达到国内先进水平。同时，中医院妇科也赢得广大患者的信任，每天从全市各地及周边县市的患者都纷至沓来，前来求诊。
