呼吸内科于1989年成立，2008年3月独立建科，位于内科楼四楼，包括普通病房、呼吸危重监护室（RICU）、呼吸实验室（肺功能、电子气管镜）、呼吸疾病研究室（筹），是重庆市第二批建设的重点特色专科（2010-2012），江津区重点专科，本院重点专科。共设床位61张，实际开放床位达80张以上。科室共有医生11名，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师5名，医师4名；其中博士研究生1名，硕士研究生4名。护士共18名，其中本科学历6名，大专学历10名，中专学历2名，其中副主任护师1名，主管护师4名。人员均在四川大学华西医院、重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属第二医院、第三军医大学新桥医院等各大医院进修学习。2004年与北京呼吸疾病研究所建立了业务合作关系，是重庆医科大学临床教学基地。
呼吸科拥有先进的设备：肺功能室有耶格大型肺功能检查仪1台、Vitalograph便携性肺功能检测仪1台；气管镜室有Olympus BP-260电子气管镜1台、治疗镜1台，Olympus BP-XT30纤维支气管镜2台；德国Drager呼吸机3台，Raphael呼吸机1台，伟康Vision无创呼吸机3台、Osmetech OPTI血气分析仪1台；心电监护仪10台；爱尔博氩等离子体凝固设备1台、爱尔博冷冻设备1台。 近10年来在《癌症》、《四川大学学报医学版》、《第三军医大学学报》、《实用内科杂志》、 《临床肺科杂志》、《重庆医学》、《实用医学护理杂志》、《中华护理杂志》等刊物发表文章50多篇。参与了全国多中心哮喘状况研究及全国慢阻肺控制现状调查研究等多个国家级课题，与重庆医科大学、第三军医大学各附属医院呼吸科均有密切联系。
2009年至2010年承担重庆市卫生局课题2项，江津区科委课题2项，黎联、牟江、万礼、桂天绪等多位医师先后在教学讲课、专业演讲比赛等方面多次获奖。 2、专科特色 对重症支气管哮喘、重症肺部感染、胸腔积液、呼吸衰竭、慢性阻塞性肺疾病、肺心病、肺癌早期诊断及介入治疗、大咯血、急性呼吸窘迫综合征、气胸、肺栓塞等的诊治积累了丰富的临床经验。能开展肺功能检查；无痛支气管镜检查，纤支镜活检、刷检，肺泡灌洗术；胸腔镜检查；胸腔积液行经外周中心静脉导管引流术，胸水进行十项以上酶学检查以及癌性标记物检查；恶性胸腔积液的胸膜固定术,包裹性胸腔积液的综合治疗；CT、B超引导经皮肺穿刺活检术；气胸水封瓶闭式引流术；支气管内肿瘤的介入治疗（氩气刀、高频电刀、冷冻）、支气管内支架置入；有创、无创呼吸支持技术等先进诊治技术。整体技术水平达到三级甲等医院重点呼吸内科技术标准，科室设备数量居重庆市内同级医院呼吸内科前列，综合实力居重庆市内同级医院呼吸内科前列。 呼吸内科主任：黎联 医学博士 副主任医师 呼吸内科副主任：牟江 主治医师 大内科主任：祝纯礼 主任医师 护士长：陈泽芬 副主任护师 护士长助理：徐健 护师。
