心内科是医院“三甲”重点科室，卫生部福建医科大学心血管病专业临床药理基地，福建省高血压研究所、《中华高血压杂志》挂靠科室。现有52张床位，心脏监护病床（CCU）7张。共有高血压、冠心病、心律失常、心力衰竭四个专业，其中高血压专业是福建省优先发展的特色专业，处于省内领先、国内先进水平。设有高血压研究室、《中华高血压杂志》编辑部、心电图室、血管功能、心功能及电生理检查室。科室现有教授3人，副教授5人，享受国务院政府津贴2人，博士生导师1人，硕士生导师4人，硕士以上学位10人（占71%）。
学科带头人林金秀教授，现任国际高血压联盟盟员、中国高血压联盟副秘书长、《中华高血压杂志》副主编。科室拥有一批年富力强、团结进取的医疗科研骨干队伍，承担或参与两项国家攻关计划、三项国家自然基金项目，获卫生部科研成果奖一项，省科技成果奖17项。科室现已成功开展冠状动脉造影、心室造影、肾动脉及外周血管造影，安装临时和永久起搏器（单腔、双腔和三腔），射频消融治疗室上性心动过速、室性心动过速，经皮冠状动脉内成形术及支架安装术，肾动脉狭窄及支架安装术，二尖瓣、肺动脉瓣狭窄扩张术，开展继发性高血压的诊断和鉴别诊断等，挽救了许多危重病人的生命。
