胃肠、外周血管外科从普通外科专业化发展而来，为医院重点科室。目前有一个病区、一个门诊、一个肠镜检查室和营养配置室。共有医师12人，其中主任医师3人、副主任医师1人、主治医师6人、医师2人，其中医学博士2人（1人在读）、硕士5人；护士14人，主管护师6人、护师4人、护士4人。
临床治疗主要包括胃肠良恶性疾病、腹腔肿瘤、腹壁疝、痔疮、肛瘘以及外周血管疾病等，广泛开展传统的腹部手术、腹腔镜微创手术、外周血管手术。其中胃肠道腹腔镜手术、胃癌根治手术、结肠癌根治手术、低位直肠保肛手术、无张力疝修补手术、吻合器痔切除手术达到国内先进水平。
