专科在消化道出血诊疗、消化性溃疡抗复发、胃肠癌早期诊断治疗、炎症性肠病的治疗、肝纤维化及急性重症胰腺炎综合治疗等方面有全面研究。科内开展的项目有：晚期食管贲门癌内镜下扩张、记忆合金支架置入治疗，胃肠道息肉内镜下电凝电切治疗，早期胃、肠肿瘤的镜下粘膜切除治疗，ERCP（内镜下逆行胰胆管造影）、EST（内镜下十二指肠乳头切开术）、ENBD（内镜下鼻胆管引流）治疗胆总管结石、急性重症胰腺炎、急性化脓性胆管炎、Oddi氏括约肌功能不良、胰管结石等，食管胃底静脉曲张内镜下硬化套扎治疗（EVS、EVL），上消化道出血内镜下药物喷洒注射止血，微波、激光止血以及钛夹止血。
科室与影像中心合作B超引导下肝穿刺治疗肝囊肿，与放射科合作肝癌DSA肝动脉栓塞化疗（TAE），肝癌经皮无水酒精注射及射频治疗，难治性腹水综合治疗，开展幽门螺杆菌14C呼气检测，消化道激素、肝纤维化指标及肿瘤标志物放免检测等。
消化内科目前为虹口区临床医疗新品牌学科，下设内镜室、荧光定量PCR 实验室、呼气实验室和腹水浓缩回输实验室，其中内镜室为虹口区内镜治疗中心。消化科现有医师13人，顾问医师2 名，护士12人。其中主任医师1名，副主任医师3名，主治医师4名，住院医师4明，博士1名、硕士3名。病区设床位33张，常年开设消化专科门诊，另开设肝炎及肠道门诊。
