建院初，医院没有专门的儿科医生，57年才设儿科医生，61年设固定儿科病床。1980年儿科独立建科，经过几十年的发展，儿科已成为宝应县及周边地区的儿病治疗中心。 儿科设固定床位30张，拥有自动心肺监护仪，婴儿光疗培育箱，超声雾化器，电脑网络管理等先进医疗设施。 目前有正主任医师1人，副主任医师3人，主治医师6人，住院医师6人，主管护师2人，护师6人，护士1人。先后派10人次去北京、南京儿童医院、上海瑞金、新华医院等处进修，在普内儿科基础上发展了神经、血液、循环、呼吸、新生儿等专科。儿科共发表论文50篇，翻译国外论文十余篇，包括：中华级3篇，国家级6篇，省级34篇。其中《血栓性血小板减少性紫癜》、《儿嗜酸细胞增多性心内膜心肌病》填充了当时国内空白。〈〈强的松治疗脾亢〉〉获得扬州市科技一等奖。〈〈过敏性咳嗽诊治〉〉获华中地区科技二等奖。〈〈心肌酶谱与肺炎心衰〉〉获华北地区优秀论文奖。其医疗技术水平，医疗服务质量也不断提高，住院治愈好转率从93.2%提高到96%以上,危重病人抢救成功率从72.3%提高到98%,病死率从2.4%下降到0.1%.
