厦门市第二医院儿科设备先进，技术力量雄厚，拥有婴儿呼吸机1台、进口多功能新生儿保暖箱2台、国产保暖箱2台，进口多功能心电监护仪1台、静脉推注泵2台、输液泵、新生儿低压吸痰器、经皮黄疸测定仪、智力测定器具等。
对儿科多发病、常见病的诊治经验丰富，在早产儿、极低出生体重儿、早期营养治疗与管理及新生儿缺氧缺血性脑病诊治积累了丰富的临床经验，还开展了中西医结合治疗肾病综合征、哮喘、癫痫专科门诊、儿童保健智力测定等，均取得了良好的临床效果和社会效应。科室有4名医师到北京、上海等地著名儿科医院进修。
儿科以严谨的作风、精湛的技术、优质的服务深得患儿家长的认可。在岛外形成专业优势。2003年床位使用率达112.36％。
