上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心儿科已有数十年的历史，主要承担新生儿和儿科感染性疾病的临床诊治工作，主攻方向为阻断妊娠合并感染性疾病的母婴传播，尤其是阻断乙肝病毒母婴传播及妊娠期肝病对围产儿的影响预防措施方面有丰富的临床经验，并获得较好的效果。
根据母亲个体状况不同，对新生儿从出生前、出生时和出生后采取相应的母婴阻断措施，进行正规的检查、检测和治疗，并由儿科专家进行定期的全程跟踪随访，及时给予进一步的医疗指导和建议。
定期随访围产期丙型肝炎病毒感染的小儿，了解丙型肝炎长期进展情况。
预防HIV母婴垂直传播，对HIV阳性母亲分娩的婴儿进行有效管理（婴儿的HIV筛查和确诊试验、预防接种、生长发育监测、体格检查、定期随访）。给予HIV阳性母亲心理关怀、进行健康教育、喂养方法指导。
对流行性脑脊髓膜炎、流行性乙型脑炎、麻疹、水痘、腮腺炎、手足口病等疾病的诊断和治疗有着丰富的经验。尤其是对重症传染性疾病，如暴发型流脑、乙脑等传染病的抢救治疗及护理方面具有较高的水平。
通过对小儿病毒性肝炎的早期诊断、早期干预，提高了治愈率，延缓了肝纤维化的发生。
参加卫生部医学分子病毒重点实验室国家级自然基金重点项目课题“母亲乙肝病毒S基因变异与母婴传播关系”的研究，获卫生部科技进步三等奖。完成一项多中心、随机、双盲的国际临床研究“阻断乙肝病毒母婴传播”。
儿科有主任医师、副主任医师各1名，主治医师2名，4名住院医师中有3名硕士生。儿科配备了现代化病房、新生儿室，德国进口的生命体征监护仪、新生儿暖箱、远红外抢救台、蓝光治疗箱、经皮黄疸测试仪、微量血糖仪、听力测试仪、鸟牌呼吸机等先进医疗仪器，有效提高了危重病人的抢救成功率。
