保健科是滦平县妇幼保健院历史最早的科室，目前主要负责全县妇幼保健工作的业务指导，协肋乡镇卫生院开展孕产妇系统管理、及儿童系统管理工作，定期下乡筛查高危孕产妇并负责全县高危孕产妇管理，开展青春期保健、更年期保健、妇女病普查、儿童听力筛查和产前筛查等保健业务。现有职业医师四人，都是保健经验丰富的行家。
保健科还负责降消项目的运作管理工作，承担着妇幼保健机构的行政事业职能。
