昆明医科大学第二附属医院血液科于1992年独立建科，是省内较早具备血液病诊治能力的血液科。目前该科是云南省唯一的血液病学继续医学教育培训基地，昆明医科大学血液系统疾病研究创新团队，云南省省级临床重点专科培育学科，中国医师协会云南省血液科医师分会及云南省抗癌协会淋巴瘤专业委员会主任委员单位，云南省血液病学首个博士学位授权学科、血液专业首个国家药物临床试验基地，2016年加入中国MDS/MPN协作组。
现任科主任周泽平教授（博士生导师）于2011年通过云南省高层次人才引进渠道从中国医学科学院血液病医院（天津血研所）引进到该科，是云南省中青年学术及技术带头人后备人才及云南省高层次卫生技术人才学科带头人。血液科现有医护人员38人，医生13人，护士23人，实验室技术员2人。其中主任医师/教授4人，副主任医师/副教授/副主任护师4人，具有博士及硕士学位10人。云南省政府引进高层次人才1人，拥有云南省中青年学术及技术带头人后备人才及云南省高层次卫生技术人才学科带头人人选。多数医生先后在美国MD. Anderson肿瘤中心、香港大学医学院、美国北卡罗莱纳大学医学院、华盛顿大学医学院、英国伦敦大学Royal Free医院、中国医学科学院血液病医院、北京大学人民医院血液科等国内外著名的血液病中心学习、进修。
目前开放病床80张，科室拥有国内一流设施的造血干细胞移植空气层流病房5间，在省内率先开展塑料包埋骨髓组织病理学诊断，拥有高清晰骨髓病理学图文报告诊断系统，COBE Spectra血细胞分离机，造血干细胞采集及冷冻保存系统。
血液科诊治范围包括：各种贫血、血小板减少、出血性疾病（血小板减少性紫癜、血友病及一些罕见出血性疾病等）、白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征（MDS）、骨髓增殖性肿瘤（慢性髓系白血病、真性红细胞增多症、原发性血小板增多症、骨髓纤维化）等血液系统恶性肿瘤和造血干细胞移植。
临床特色：①基于国内外指南为依据的恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤标准化分层精确治疗及骨髓病理辅助诊断；②难治性血小板减少症；③在省内率先开展微移植治疗血液系统肿瘤；④急性白血病等血液肿瘤的大剂量化疗；⑤急、慢性再生障碍性贫血、骨髓异常增生综合征、及自身免疫性溶血性贫血的综合治疗，不明原因发热等疑难病症的诊断和治疗；⑥造血干细胞移植治疗恶性血液病。治愈好转率处于省内领先，国内先进水平。该科的优势专业包括恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性白血病的规范化诊疗、出血及血栓性疾病。
该院是造血干细胞移植定点医院，目前可常规开展自体及异基因造血干细胞移植。该科2001年10月开展了第一例造血干细胞移植。2006年5月开展了CD34阳性细胞分选造血干细胞移植治疗系统性红斑狼疮。2007年2月开展异基因造血干细胞移植。2015年成功开展了云南省首例“微移植”治疗急性髓系白血病。
血液科为昆明医科大学博、硕士研究生培养点（为云南省血液学专业首个博士研究生培养点），目前有博士生导师2名，硕士生导师3名，已毕业研究生65人。近年来每年聘请内地及香港地区著名专家，组织血液学专业国家级继续教育培训项目。并接待外国留学生短期学习。目前聘请中国医学科学院血液病医院（天津血研所）杨仁池教授为该科客座教授。并与香港大学开展了科研及临床合作。
血液科在基础和临床研究方面在全省血液学领域遥遥领先。该科近五年来共主持国家自然科学基金7项，云南省科技厅、教育厅等科研项目10余项，参加国家公益性卫生行业专项、省部级重点项目多项，与香港大学及中国医学科学院血液病医院合作项目3项，获得科研经费总计500余万元。研究领域涉及急性白血病、造血干细胞移植、淋巴瘤、血小板减少性紫癜、地中海贫血等。
目前为止获得省部级一等奖1项，三等奖9项、教育部二等奖1项，血栓与止血大会“青年研究奖1项。发表论文100余篇，SCI收录论文23篇。参编英文专著《Handbook of Disease Burdens and Quality of Life Measures》及中文专著《临床路径释义》、《血液病诊疗规范》、《血友病》第二版的编写。先后在第11届国际血液学会亚太区分会，24、25届国际血栓与止血学会年会，第11、12、13届全国血液学年会，第12、13、14届全国血栓与止血年会等国际、国内学术会议上发言。参与修订《中国成人免疫性血小板减少症诊断与治疗专家共识》。
目前血液科重点建设亚专业包括：急性白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、造血干细胞移植、出血及血栓性疾病等。血液科在全省率先开展骨髓活检工作。该科多年来致力于出凝血疾病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤的基础和临床研究，参与了多项国内多中心新药临床试验。目前在血液肿瘤尤其是淋巴瘤、多发性骨髓瘤的诊疗方面基本与国际接轨。在免疫性血小板减少症的诊治方面处于国内领先水平。
血液专业的多个省内第一：
首个血液学专业博士学位授权点
首个血液专业国家药物临床试验机构
首个血液系统疾病研究创新团队
首个血液专业留学回国人员
首本血液学专著出版
首先开展塑料包埋骨髓组织病理学诊断
首先开展微移植治疗技术
首获国家自然科学基金
首先在国际会议发言
