头颈外科成立于1972年，是江苏省成立最早诊治范围较全面的头颈肿瘤专科，承担了江苏省头颈肿瘤诊治、教学、科研任务，已成为江苏省和周边省市头颈肿瘤的诊治中心。目前有床位数46张，年收治头颈肿瘤病人约700余例，其中神经外科各类肿瘤近150例。主要收治口腔、涎腺、鼻腔副鼻窦、咽（鼻咽、口咽、下咽）、喉、甲状腺等部位的肿瘤，神经外科包括幕上、幕下及深部和脑干肿瘤。
头颈肿瘤外科以手术治疗为主，辅以放疗、化疗等综合治疗手段，其头颈肿瘤治疗的5年生存率达80%。近年来所开展的涉颅底手术、鼻咽癌放疗失败的手术挽救、游离空肠吻合修复下咽及食道上段术后缺损、游离皮瓣舌再造、保留发音功能的部分喉切除和侵犯气管食管的晚期甲状腺癌根治、单双侧颈动脉体瘤切除术及神经外科肿瘤的综合治疗等均居国内和省内领先。近2年头颈肿瘤外科联合神经外科成功完成了巨大复发性高位椎管内外神经性肿瘤根治切除和结扎颈内动脉的颅底迷走神经体瘤的切除。
