普儿科成立于1958年，设有小儿呼吸、心脏、神经、血液、消化、肾脏、内分泌等专科，目前开放床位98张，年门诊诊疗10万余人次，年收治病人3000余人次，技术力量雄厚，拥有主任医师3名，副主任医师6名，硕士研究生2名，对儿童常见病、多发病诊治积累了丰富的临床经验。2005年成立PICU，对儿科危重疾病如各种原因导致的呼衰、心衰、脑水肿等采用多功能监护仪、呼吸机、气泵等先进的监护、抢救设备进行救治，大大提高了危重儿抢救成功率。
呼吸专科开展了微量支气管扩张剂气泵吸入辅助治疗毛支炎，对缓解患儿喘憋症状效果显著。最具特色的是成立了儿童哮喘防治中心，采用与国际接轨的哮喘防治规范化诊疗和医院家庭化管理手段，在淮安率先开展以吸入为主的综合治疗方案、过敏原皮肤点刺试验、儿童肺功能测定等技术，为哮喘儿童建立专病档案，制订个体化的治疗方案并进行定期随访观察，目前有1000余例接受专案管理的哮喘患儿，病情均得到了良好控制。哮喘防治中心的影响力不断向周边城市扩大，宿迁、盐城、连云港等周边地区不断有患儿慕名前来就诊。在神经内科方面，对癫痫、脑损伤儿的早期诊断以及抽动症、多动症的诊疗积累了丰富的临床经验，并为癫痫、脑损伤儿建立专病档案。消化专科方面，对腹泻病、腹痛、消化道出血的病因诊断积累了丰富的临床经验，并开展了小儿消化道内窥镜检查。内分泌科在肾小管性酸中毒合并重度营养不良、肾上腺皮质增生症、先天性甲状腺低下等先天性遗传代谢性疾病的诊疗方面疗效显著。
近年来，在省级以上杂志发表论文30余篇，《IL-13基因多态性与儿童哮喘的关系》获市科技进步三等奖，《哮喘患儿IL-13基因多态性与血清ECP水平的关系》获市自然科学一等奖。
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