胸心外科是本院近年来发展较快的科室，８７年起开展体外循环手术。目前已常规开展各类心内直视手术，如：房间隔缺损、室间隔缺损修补术、法洛氏三联症、四联症矫治术，心脏瓣膜置换术、心脏起搏器植入术、左心房粘液瘤切除术等。近6年来还开展了心脏移植术，冠状动脉搭桥术等。普胸外科已经有四十余年历史，常规开展各段食管癌根治术、各类纵隔肿瘤切除术、各类肺癌手术以及隆突支气管手术等等。近年来又开展了胸腔镜手术。科主任方良伟，主任医师，为淮安市医学会胸心外科学会副主任委员。胸心外科目前有主任医师一人，副主任医师两人，主治医生住院医生三人。
