福建省妇幼保健院儿科拥有正、副主任医师12人，主治医师6人，住院医师10人，其中硕士研究生5人。开设神经科, 内分泌科, 哮喘病, 肾脏病等儿科专科门诊，由拥有丰富临床经验的高年资主任医师坐诊。病房编制病床数张，年门诊量近25万人, 年出院人数约6000人。
病房中开设家庭病房、两人间、三人间等各种类型，满足广大患者的需求。儿科拥有全省唯一的儿科重症监护室(PICU),该科以心血管和呼吸专业为主，结合其它专业组成。PICU配备有中心供氧系统、正负压吸引系统、中央空调系统、西门子900C呼吸机、千禧婴幼儿呼吸机、CPAP无创呼吸机、日产中央监护仪及床旁机、喉镜、输液泵、微量注射泵、血气分析仪, 微量血糖仪、远红外复温床、经皮黄疸测定仪及床边X光摄片机等先进设备。同时拥有一支技术精湛的医护队伍，经过专业培训，为危重症婴幼儿提供全方位高质量的服务，危重病例抢救成功率达95%以上。
科室还拥有专门的实验室，拥有美国普特生13碳红外线检测仪进行无创胃幽门螺杆菌检测，西班牙产肺功能仪及MORA-SUPER过敏诊断治疗仪可行肺功能检查和1500种过敏原检查。近年来，科室医护人员在国内著名儿科刊物上共发表论文100余篇，其中类胰岛素生长因子及结合蛋白临床检测应用的论文在欧洲小儿生长发育会议上大会宣读，目前承担5项科研项目。科室承担全省各地进修医生培训及福建医科大学教学任务, 参与儿科硕士生培训工作。
