北京大学第三医院超声诊断科创建于1960年，是国内最早开始从事超声诊断的医疗机构之一。如今它已经发展成为综合性的超声诊断科，拥有世界一流的超声设备，建立了合理的专业人才梯队，具有培养博士和硕士研究生的能力，在医疗、科研和教学方面取得了可喜的成绩。
超声科现有工作人员41人，其中主任医师8人，副主任医师6人，副研究员1人，分为五个专业组，每天约检查病人800余次，全年检查病人约16余万人次，介入性超声1000余人次。超声检查服务范围包括腹部超声、浅表器官超声（甲状腺、乳腺等）、血管超声、肌肉骨骼系统超声及介入超声的诊断和治疗。除进行常规超声检查外，还可完成超声造影检查等最新的超声成像和诊断功能，对于病变的早期发现和良恶性的鉴别诊断具有很高的价值。
北京大学第三医院超声诊断科在国内率先开展超声引导下自动活检新技术，它是将自动活检装置与现代影像技术实时成像相结合，用于人体各部位多器官组织病变的穿刺活检，收到令人满意的取材效果。该技术具有快速高质量取材、安全准确地作出病理诊断、简便易行等优点。超声引导自动活检的临床应用可进一步提高现代医学影像技术的准确性，使临床诊断迅速达到病理组织学诊断水平。自1993年以来已成功举办国家级继续教育学习班，有力的推动了自动活检技术在全国范围内的普及应用。
北京大学第三医院超声科依托我院运动医学和骨科的雄厚实力，努力探索超声在肌肉骨骼系统疾病方面的应用，积累了丰富的经验。目前运用超声检查肌肉、肌腱、韧带、关节、骨骼的各种损伤、炎症、肿瘤等，已成为我院超声科的一个特色检查项目，在国内处于领先地位。至2010年我科已成功举办了多届国际及全国肌肉骨骼超声新技术研讨会及学习班，进一步加强了我院超声诊断科在国内的影响力，并有力地推动了肌肉骨骼系统超声检查在全国范围内的更好更快地发展。
为了更好的为疼痛病人服务，更好的甄选适合超声引导下治疗的患者，以利于实行个体化
精确治疗，超声科特开设疼痛及介入超声门诊，出诊人员为副主任医师及主治医师，均具有
影像介入治疗资质及丰富的介入治疗及疼痛治疗经验。
