北京同仁医院于50年代成立了泌尿外科学组，著名的泌尿外科专家吴阶平教授曾多次来院指导肾上腺疾病的研究工作，指导手术，使泌尿外科学组积累了丰富的经验，取得了一定的成绩。随着医学的发展和社会的需求，1984年正式成立了泌尿外科，在泌尿外科多种疾病的诊断、治疗及学术研究方面得到了进一步发展。目前在腔内泌尿外科方面处于领先水平。拥有先进的钬激光治疗系统，大型体外冲击波碎石等一系列设备，尤其在钬激光碎石、膀胱肿瘤治疗方面具有独创特色。
1993年，在同仁医院成立了北京市泌尿外科会诊中心，该中心荟萃了吴阶平、郭应禄院土等一批国内优秀泌尿外科专家，"中心"为各种疑难病患者提供会诊、检查、治疗、手术等一条龙服务。中心的专家各个身怀绝技，在各自的领域内有很高的威望和丰富的经验，对前列腺、肾上腺、泌尿系肿瘤、尿石症、男性性功能障碍等疾患进行会诊和医疗服务。会诊时间：每周三下午。
