慢性扁桃体炎时，隐窝内上皮坏死脱落，细菌及炎性渗出物聚集其中，隐窝可产生小溃疡及瘢痕形成而引流不畅，适于细菌生长繁殖，故感染不易消除。屡发急性扁桃体炎，使机体抵抗力降低或治疗不彻底，则更易转为慢性。本病发生机理尚不清楚，但近年来基于免疫学的观点，认为自身变态反应为引起慢性扁桃体的重要机制。

1.慢性扁桃体炎的病人应养成良好的生活习惯，保证充足的睡眠时间，随天气变化及时增减衣服，去除室内潮湿的空气，都是重要的。对于患病儿童，应养成不挑食、不过食的良好习惯。　　

2.坚持锻炼身体，提高机体抵抗疾病的能力，不过度操劳，若劳累后应及时调整休息。戒除烟酒，是预防慢性扁桃体炎的重要一点。　　

3.患扁桃体急性炎症应彻底治愈，以免留下后患。　　

4.预防各类传染病、流行病。流食或半流食，发热高者町用酒精擦浴，协助降温。　　

5.积极治疗急性扁桃体炎可预防本病。

应根据病史，结合上述症状及体征进行诊断，而不应以单纯扁桃体的大小为依据，因为随着年龄的增长，扁桃体在不断缩小，慢性扁桃体炎分为三种类型，即增生型、纤维型和隐窝型，所以扁桃体的大小并不表明其炎症程度，故不能以此作出诊断。　　　　

检查可见扁桃体慢性充血，扁桃体表面不平，瘢痕，与周围组织有牵连，有时可见隐窝口封闭，呈黄白色小点，其上盖有菲薄粘膜或粘连物。隐窝开口处可有脓性分泌物或干酪样分泌物，挤压时分泌物外溢。舌腭弓及咽腭弓充血。下颌淋巴结肿大。　

慢性扁桃体炎已引起全身并发症时，血清中甲种，丙种球蛋白与粘蛋白多异常增高，而反应性蛋白检查多为阳性，抗链球菌溶血素“O”之效价增高，血沉亦多加快。通过免疫组织化学检查，氨基酸定量，血清中α2蛋白高价，对病灶性扁桃体炎有重要意义。利用电子显微镜和血清荧光抗体检查，在扁桃体组织切片中，确定出扁桃体形成的质量变化(IgG占优势)，如能确定这种变化主要位于隐窝-淋巴间质内(后者在正常情况下没有这种功能)，就有充分依据证明在腭扁桃体内有潜在性或活动性病灶存在。