该科于2002年在漳州市医院眼科基础上成立，担负着漳州地区眼科医疗、教学、科研、预防任务。中心现有专业医务人员20余人，其中高级职称4人，中级职称5 人设有住院病床30张。近年来，更新、引进了美国眼力健白内障超声乳化仪、博士伦玻璃体切除机和日本尼德克准分子近视激光治疗系统，与原有的YAG 和半导体眼底激光系统、CO2冷冻机、数字眼底荧光血管造影机、眼科AB超声波检查仪、非接触眼压计、眼电生理检查系统和视野计、电脑验光仪等构成先进的眼科诊疗设备，为470万漳州人民提供优质高效的眼科医疗服务。
该科开展白内障冷超声乳化手术、玻璃体切除术、准分子激光近视手术、视网膜脱离复位术、眼底激光治疗和角膜、干细胞以及羊膜移植手术，青光眼诊疗、眼外伤、眼肿瘤和整形手术也占领先地位，曾两次获漳州市科技进步奖，在十几种专业杂志发表近百篇论文。
白内障超声乳化吸除人工晶状体植入术具有手术切口小，术后散光少，视力恢复快，效果好等优点，是当前治疗白内障最先进的技术，经多年大量病例的临床手术验证，已在世界各地推广。传统手术方法需等白内障成熟，患者可能长时间忍受低视力的痛苦，而使用超声乳化技术，只要白内障患者视力低于0.3-0.5，影响正常生活，即可考虑手术。漳州市医院眼科开展白内障超声乳化手术已有10年以上的历史，积累了丰富的临床经验，近年来更新换代的美国最新眼力健超声乳化仪，具有“冷超乳”和“冰超乳”的功能，乳化过程中产热少，减少对眼组织的热损伤，更加安全可靠。
玻璃体切除术是治疗玻璃体视网膜疾病成功率高的技术。主要适应症为:1.各种原因引起的玻璃体积血、混浊、机化、增殖等如眼球穿通伤、增殖性糖尿病视网膜病变、视网膜静脉周围炎、视网膜中央静脉阻塞；2.复杂性、牵拉性视网膜脱离；3. 眼内异物；4. 感染性眼内炎；5. 黄斑部疾病等。
漳州市眼科中心近年开展准分子激光手术，为无数近视者恢复明亮视力，使之重树美好生活的自信心。准分子激光角膜原位磨镶术（Lasik）是全球公认治疗近视、远视、散光的最好方法，具有安全可靠、方便快捷、效果稳定、手术不痛苦的特点。
眼底激光可用于治疗视网膜多种疾病变如糖尿病视网膜病变、中心性浆液性脉络膜视网膜病变、视网膜静脉阻塞、视网膜周边变性、干性裂孔和青光眼。
电脑视野计为早期青光眼，视神经病变及颅内占位性病变提供有意义的诊断。眼电生理检查可以检查客观视觉功能，在预测术后视力及司法鉴定上有重要价值。1982年即率先在省内开展的眼底荧光血管造影技术，为眼底病的诊断提供了可靠的依据。
“爱眼护眼，防盲治盲，精益求精，全心全意”是漳州市眼科中心的服务宗旨，在视觉第一，复明工程行动中每年多次深入基层，高质量完成的大量的白内障手术，多次获省市政府授以的先进集体和个人称号。
