中医科成立于1981年2月，经过我科医务人员的努力，该科总体医疗、教学和科研能力得到提高，获全国综合医院中医药工作示范单位，组建有特色专科、针灸、肛肠专科。
历届中医科主任：阮育民 刘建国 冮顺奎
现任中医科主任：沙剑轲
现有各级医师8人，云南省名中医及主任医师2人，副主任医师2人，主治医师4人。
［医疗工作］
每年平均诊治门诊人近4587例次
每年平均收治住院病人近621例次，完成肛肠手术近256例
［科研工作］
先后完成《改良骨骶裂孔定位法的发现及应用》，《四黄乙醇膏防治静脉留指针所指静脉炎临床应用》等五项获得地市科技进步奖
［对外交流］
省中医学会、省针灸学会
