神经外科创建于1981年，学科创建人是我市著名外科专家殷名芳主任医师，当时是与五官、口腔科合在一起，能够开展脑血管造影术、颅内血肿清除术、半球肿瘤切除术、椎管内肿瘤切除术等。1994年神经外科独立建科，业务发展较快，拥有莱佧神经外科手术显微镜、德国蛇牌双极电凝等设备，在医疗、教学和科研水平上一直居于我市领先地位。现有床位32张。长期住院病人在45人以上。
历任神经外科主任：殷名芳 历任神经外科副主任：王有昌
现任神经外科主任：马 俊 现任神经外科副主任：郎沛灵
有各级医师11人，其中主任医师1人，付主任医师4人，主治医师4人。主治医师以上均到过北京、华西等知名医院进修学习。每年均有医师参加国内的各种学术交流。
医疗工作
每年平均收治住院病人达1000人以上，每年完成各种大中型手术百余例，包括各型颅内血肿清除、各型颅内肿瘤切除、脑动静脉畸形切除、椎管内肿瘤切除、高血压脑出血锁孔清除等。
科研工作
承担着全市的医疗、教学和科研工作，先后有11项研究成果获昭通市科技成果二等奖、三等奖。
对外交流
多次邀请昆医附一院、附二院神经外科专家教授亲临讲学、指导工作，多名医师多次到昆明、北京、四川等地参加学术交流。
