中山大学附属第三医院消化内科是广东省临床重点专科，中山大学消化内科学硕士和博士培养点、以及博士后流动站，也是分子生物学博士培养点与博士后工作站，国家973计划首席科学家单位，中-美联合肝癌研究中心主体单位。目前在读硕士研究生、博士研究生、博士后几十名。消化内科由二个消化专科病区、消化专科门诊（包括专家门诊、专科门诊、特需专家门诊）、消化内镜中心、胃肠功能室、分子消化疾病实验室、临床消化疾病实验室六个单元组成，是集医疗、教学、科研为一体，充满活力、不断发展壮大、面向国际化的学科。
该学科拥有医师20名和实验室研究技术人员2名，其中高级职称医师8人，主治医师4人，住院医师8人。有博士学位9人，硕士学位13人。消化内科医疗工作主要覆盖的疾病包括：食道、胃、小肠、大肠各种疾病，肝、胆、胰腺、腹膜等相关疾病，如消化道出血、消化性溃疡、炎症性肠病、胰腺炎、肝硬化、胆道结石（黄疸）及消化道肿瘤（食道癌、胃癌、结肠癌、胰腺癌、肝癌等）等。消化内镜中心拥有世界最先进的各种内镜整套设备及技术，是广东省开展消化内镜诊断及治疗项目最全面的医院之一，每年完成二万例次以上的内镜检查及内镜治疗。消化道出血、肝硬化、肝癌、肝功能不良、消化道肿瘤、炎症性肠病、反流性食管炎的诊治是该科的特色，食管胃静脉曲张的内镜微创治疗、胃肠道早期癌的诊治是该科的优势。
科室与日本佐贺大学医学部、美国哈佛大学、美国斯坦福大学、美国耶鲁大学、香港大学、香港中文大学等国际一流大学建立了良好的合作交流关系，这些合作必将促进消化科向国际化迈进。
