目前主要由邓艳红博士负责，主要开展胃肠道肿瘤包括食道癌、胃癌、十二指肠癌、结直肠癌、肛管癌、胃肠道间质瘤、胃肠道淋巴瘤、胰腺癌、肝癌等除手术外的综合治疗，治疗手段包括根治性化疗、新辅助化疗、辅助化疗、姑息化疗、免疫治疗、生物治疗、靶向药物治疗及中医中药治疗和最佳的支持治疗等。
科室与中山大学附属肿瘤医院放疗科合作开展各种胃肠道肿瘤的放疗、同期放化疗、序惯放化疗等。并与多个国际知名的消化系统肿瘤中心有紧密合作，在新药物、新方法和新技术的引进方面，有非常通畅的渠道，使我们的治疗手段能一直与国际最先进的水平保持同步。以肿瘤标志物检测相关技术设备建立的生物芯片技术平台，可以检测到肿瘤的早期信息，能为患者做到早期诊断、早期治疗、疗效评价、预测复发转移等。
另外，在重视肿瘤上述综合治疗手段的同时，科室医务人员亦特别重视精神、心理因素在肿瘤发生和治疗中的重要作用，重视患者的心理治疗，为患者提供个性和人性化的关爱和服务，能最大限度的满足广大患者的需要。对消化道肿瘤的治疗，中山大学附属胃肠肛门医院强调以手术为主的综合治疗，优秀的临床实践，已显示出了良好的临床效果，如结直肠癌的术前新辅助化疗在术前肿瘤减期、减低术后局部复发等方面，术前放化疗在提高直肠癌的根治性切除率、保留肛门括约肌及其功能、提高术后生活质量和5年生存率等方面，都显示出了显著的优势。
多学科综合的肿瘤治疗模式已成为中山大学附属胃肠肛门医院胃肠道肿瘤治疗的一个特点，综合治疗科在这种模式中扮演积极和十分重要的角色。
