呼吸科是医院的重点学科，现有医护人员18人，其中副主任医师以上的高级技术人员4人，主管护师3人。该科设有普通病房、重症监护室、肺功能室、纤维支气管镜室，拥有一流的进口有创和无创人工机械呼吸机、肺功能仪、纤维支气管镜、血气分析仪、睡眠呼吸障碍检测仪及多功能重症监测仪等大型医疗设备。该科科研、医疗技术力量雄厚，承担了国家级、省部级、局级等科研课题多项，发表医学论文数十篇。该科擅长于诊治各种肺科常见病，能成功抢救ARDS、支气管大咯血、各型呼吸衰竭、急危重症及疑难杂症；能熟练进行纤维支气管检查、肺功能检测等，在肺癌治疗及呼吸衰竭机械通气治疗等方面均有独到之处。其睡眠呼吸监测是重庆市三大重点单位之一。科室常年聘请重庆著名呼吸专家会诊，并指导临床及科研工作，使该科专科技术水平同步于国内同行之前列。
