五官科成立于建院之初。目前五官科有3名医生，其中眼科主治医师一名，耳鼻咽喉科主治医师一名。其中眼科刘妙娟医师从事五官科临床工作近30余年，临床经验丰富。目前医院与闽东医院合作后，闽东医院耳鼻咽喉科和眼科均有下派医生在该科室工作。
科室门诊设有综合诊室、鼻内镜、纤维喉镜室、微波治疗室、听力筛查和检查室、眼科检查暗室、眼科A/B超检查室、眼科电生理检查室、门诊小手术室等。科室配备了德国艾克松纤维鼻咽－喉镜、耳鼻科动力系统、鼻内窥镜系统、丹麦新生儿听力筛查仪、丹麦纯音测听仪、日本拓普康非接触眼压计、日本拓普康自动电脑验光仪和角膜曲率计，眼科视觉电生理检查、眼科A/B超、莱卡620眼科手术显微镜等多种种现代化医疗设备。
耳鼻喉科开展鼻窦内窥镜下鼻炎、鼻息肉、鼻中隔矫正手术、全麻下扁桃体和腺样体手术、支撑喉镜下声带小结、声带息肉、会厌囊肿等手术，耳前瘘管切除等手术。
眼科开展屈光检查、斜弱视治疗，各类眼外伤、倒睫、睑内翻、翼状胬肉、白内障复明等显微手术及相关眼内科治疗。2010年以来，科室与周宁县残联合作，响应国家白内障“光明行动”号召常年为广大白内障患者免费进行白内障复明手术，取得良好的社会效应。
