2001年5月8日儿童医院正式组建青春期门诊,成为全国第二家专科诊室,全方位开展0—18岁的儿童生长发育、性发育(因性发育有生理年龄和病理年龄之分,所以跨度为0—18岁)、性心理发育,是目前全国青春期医学门诊专业性强、规模大、覆盖面宽、门诊量最大的专业门诊。2004年4月15日又创建全国首家小儿男科、东北三省首家小儿妇科。对于青春期医学的研究处于国内领先地位,已累积诊治四万余名与青春期医学相关疾病的病儿,建立门诊病历档案一万五千余例,受到省内外有关专家和患儿家长的好评。