中蒙医院蒙医科成立于1984年,现有医生3人,其中主任医师1人,住院医师2人,护士10人。
科室设有门诊、病房,是以治疗内科疾病为主的蒙医特色科室,主要以传统蒙医药技术治疗风湿、类风湿、胃病、肝胆疾病、神经性头痛、心血管病、脑出血、高血压、糖尿病、呼吸系统疾病等。尤其对布氏杆菌病、脑囊虫病的治疗有独特效果。此外,蒙西医结合并借鉴现代医学监测手段的综合治疗方法治疗急性心梗、急性心功能衰竭、呼吸衰竭、急性消化道出血、肝昏迷、糖尿病酮症酸中毒、脑出血、出血热等均取得满意疗效。在国家及省级杂志共发表论文十余篇。