珠海市第二人民医院综合科包括男性科、不孕症专科、皮肤性病科、中医内科、中医骨伤、康复理疗科、高压氧科及血磁科，其中男性科、不孕症专科为本院有特色的专科。
男性科：有主任医师1名，主治医师1名，配有激光器、尿流仪、睾丸大小测定仪、多参数阴茎勃起硬度定量分析仪、取精仪、精子分析仪等先进设备，专门研究和治疗男性前列腺疾病、性功能障碍、不育、外阴疾病、男性性传播疾病以及男性养生保健等。
不孕症专科：有主任医师1名，对因排卵障碍、输卵管阻塞、染色体病变及习惯性流产所导致的不孕症有独特的治疗方法和经验。
皮肤性病科：有主治医师2名，配备二氧化碳激光治疗机，并设有真菌实验室，治疗各类皮肤病及性传播疾病。
中医内科：有主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名。利用中医中药治疗支气管炎、哮喘、肾炎、泌尿系结石、胃炎、高血压、冠心病、糖尿病等各类疾病，另设肝病专科（为本院有特色的专科之一），擅长诊治各类型肝炎、肝硬化、肝腹水、肝癌、肝胆结石。
中医骨伤科：有主治医师3名。利用传统医疗手段结合现代诊疗技术（中药内服、外敷，手法治疗，夹板固定，刮痧，骶管注射，机械牵引等），治疗跌打损伤，骨折脱臼，颈、肩、腰腿痛，瘫痪，神经肌肉痛等。
康复理疗科：有主治医师3名。设备齐全，有各类治疗仪器40余台，如颈、腰椎牵引仪，红外线、超短波、微波、电磁波、激光、电脑等多种治疗仪，中药熏蒸床，结合传统推拿、按摩、针灸等治疗手段，集治疗疼痛及预防保健、康复训练于一体。
高压氧科及血磁科：有副主任医师1名，配备大型高压氧仓及血液磁极化治疗机。高压氧可治疗各类急性全身性缺氧及局部缺氧性疾病等，血磁主要对高血脂、血液粘稠度高的人有效，也可用于消除疲劳及保健等。
