扬州妇幼保健院妇科设有普通门诊、专家门诊、计划生育门诊和激光微波治疗，电子阴道检查等。为了提高专科疾病诊疗水平，妇科设有妇科内分泌门诊、妇科肿瘤门诊和中医妇科门诊。98年引进的妇科内窥镜诊疗技术，已为上万名妇科患者解除了痛苦，尤其给许多不孕症患者带来了福音。宫腹腔镜联合使用诊疗不孕症还填补了市内这一区域的空白，达到了国内领先水平。妇科现有高中级专业技术人员20余名，除精于常见病诊治，还擅长各种疑难病诊的诊治以及各种高难度手术，如广泛性子宫切除及盆腔淋巴清扫，卵巢癌根治术，阴道成形术和输卵管复通术，为广大妇女患者架起了通往健康的桥梁。
扬州妇幼保健院产科设有胎儿大学、胎儿监护室、婴儿沐浴游泳池、光波疗房、围产期保健门诊、产前诊断门诊、产后康复治疗室等。多年来，产科坚持为市区及周边地区孕产妇提供优质服务。开展了孕产妇围产期系统管理，妊娠期肝内胆汁淤积症，胎儿宫内发育迟缓，妊娠高血压综合症的专病研究，推行早孕建卡，产前诊断，孕期、产期、产后全程监护，计划分娩，有陪待产，家庭式分娩，新生儿疾病筛查等一系列以母子为中心的医疗保健服务。98年开设胎儿大学，使近两万对夫妇获得孕期保健和科学育儿等方面的知识。经过多年的不断努力，产科质量不断提高，已连续14年无院内孕产妇死亡，新生儿窒息和围产儿死亡率显著下降，产科其它质量指标也位居省内先进水平。产科现有高级专家7名，设有标准双人房间52个，家庭式分娩房间15个。
