黑龙江省第三医院神经外科始创于1962年,具有悠久的历史,为黑龙江省北部地区神经外科中心。现有主任医师一名、副主任医师4名、主治医师2名、医师1名、优秀的护理人员20余名,设立床位44张,其中IUC病房床位8张。已开展的手术有:各种颅脑损伤、脊髓损伤、高血压脑出血、脑血管畸形、颅内动脉瘤、脑膜瘤、胶质瘤、听神经瘤、垂体瘤、颅咽管瘤、脑积水、颅内寄生虫病、脊髓肿瘤、腰间盘突出症、特发性帕金森病、癫痫、精神分裂症等。
近年来开展的亚低温治疗大大提高了颅脑损伤的治愈率;高血压脑出血的微创手术治疗,降低了手术费用,提高了治愈率;显微神经外科的应用,更进一步提高了总体手术的治愈率;脑立体定向及功能外科的开展,为省内首创。在国内处于领先地位。