首都医科大学附属北京中医医院针灸科成立于1956年，是我国公立医院成立最早的针灸科之一。建科之初荟萃京城名医，云集针灸流派，拥有享誉中国针灸界“南陆北王”之中的“北王”——“金针”王乐亭、“管针”贺惠吾、早年留学日本的夏寿人、火针大师贺普仁等多位国内享有盛誉的针灸学大家。在京城百姓中宿有良好的口碑。大师们在针具、组方、刺法、临床等方面积淀了深厚的底蕴，形成了北京地区特色的针灸流派。时届50余年，历经四代学科带头人，科室认真传承多位大师经验，不断创新发展，在临床医疗、科学研究、针灸教学各方面都取得了显著成绩。1998年被批准为北京市中医针灸重点专科建设单位，2000年通过验收。目前是北京市“十一五”中医药发展计划的优势项目-北京市针灸强化建设学科的牵头单位。2001年被批准为北京市中医针灸重点学科建设单位开始学科建设，已通过验收。自2002年至今是国家中医药管理局“十五”重点专科建设单位，“十一五”强化建设单位。2002年被北京中医药大学针灸学院指定为国家中医药管理局针灸重点学科建设协作单位，已通过验收。2007年被评为首都医科大学针灸优秀教研室。目前是国家和北京市重点学科和重点专科，2009年科室升级为北京中医医院针灸中心。
中心拥有三个病区、100张病床、一个二级科室(心身医学)、一个针灸学研究室和多个专病专台。设有抑郁专台、偏头痛专台、耳鸣耳聋专台、失眠专台等。其中2000年张捷主任医师开设的抑郁专台治疗方法包括针刺、艾灸、走罐、电针、中药、心理治疗等综合疗法，逐步形成了具有特色的诊治体系和学术队伍，开展参与多项临床科研，在国内拥有一定的学术地位和社会影响。2002年以周德安主任医师为首建立了睡眠障碍专台，“治神十法”疗效显著。2003年王麟鹏主任医师建立偏头痛专台，制定了详尽的专台诊治手册，开展针灸预防偏头痛的研究。
依托临床特色，目前年出院病人达1700余人次，年门诊量13万人次。针灸特色明显，多种针法并存，突出针灸便、廉、验的优势为众多患者进行了常见病、多发病的针灸治疗。如“要扎针上宽街”之语在百姓中口传，“医术精，医德好”之誉在网上频现。诊疗技术高超，疗效优势显著，为大量的疑、难病症患者提供了有效的针灸疗法，引起了社会的极大反响。
