亚健康是介于健康与疾病的中间状态，机体无明显疾病，但是却出现许多不适症状。许多疾病发生前期，均伴有长时间的亚健康状态，如果任其发展，常会发展为心脑血管、内分泌、呼吸道等疾病甚至肿瘤。据世界卫生组织统计，目前全世界亚健康人数已占到总人口的75%，亚健康已成为21世纪危害人类健康的主要因素。
该院亚健康科于2008年成立，是国家中医药管理局重点专科项目，北京市三级甲等中医院中唯一的亚健康专业科室，具有高级职称、博士学位、硕士学位中医师8人、专业护师2人，经过多年的临床诊疗及学科研究，形成了亚健康及慢病的中医预防保健学科体系，在中医“整体观”、“天人合一”、“心神合一”等辨证思想基础上，形成了28个不同人群的中医诊疗体系。
诊疗体系包括中西医健康状态评估，中医诊断，中药、经络治疗，自我养护等多种中医特色诊疗手段，诊疗范围包括各种亚健康证候（包括慢性疲劳、失眠、肥胖症、戒烟、不定陈述综合征、不良情绪等），常见重大疾病的病前状态及慢病康复调治、病后调理（包括代谢综合征、免疫力低下、过敏体质、早衰防治等），以及慢性病、手术后、产后及青春期、更年期等特殊时期中医综合调理，中医体质测评，健康咨询，养生指导。
独特诊疗体系：以中医辨证为纲领，制定综合性个体化治疗方案。
特色检查手段：中医体质辨识、红外热成像分析、心率变异分析、体质测评、各种健康、心理测表等。
中医特色疗法：内服法如中药汤剂、膏方、药茶；外治法如针灸、拔罐、耳豆、中频、激光、药物离子导入、足浴等；以及日常饮食、起居、运动等咨询指导。
