新疆医科大学附属肿瘤医院胸肝外科（在原肿瘤医院外三科基础上）于2005年2月成立。科室设三个病区，为肝、胆、胰病区，食管、贲门病区，肺、纵隔病区；分别位于外科病房大楼的11、10、9层。目前科室具有正、副主任医师9人，其中主任医师2名，教授1名，副教授1名，博士2名，硕士6名，硕士研究生导师3人。
肝、胆、胰外科病区：主要诊治各类肝、胆、胰外科疾病，年肝切除病例在150例以上，并开展了肝移植手术，取得较好的效果，所移植病人至2006年均健康存活；胰腺外科年胰十二指肠切除病例达50余例，术后无胰瘘发生，改良式无血切肝，改良捆绑式胰肠吻合术已达到自治区先进水平，并开展腹腔镜微创外科手术。
