通大附院儿科成立五十多年来，在医疗、教学、科研等各方面在南通地区乃至整个苏北地区，起到一个领头羊、排头兵作用。具有一支医疗技术一流的医护队伍，目前拥有高级职称16人，中级职称12人，博士生一人，硕士生9人。有一人享受国务院特殊津贴，有江苏省医学会儿科学会各专业组委员11人，南通市医学会儿科学会主任委员1名。科室分为血液、肾脏、新生儿、神经、心血管、呼吸、内分泌、、消化、急救、儿童保健等专业组，并有相应的专科门诊。
每年有无数例濒临死亡边缘的患儿，在通大附院儿科经过积极抢救得以再生，如重症心肌炎伴阿—斯发作、重症脑炎、高血压脑病、感染性休克、呼吸衰竭、心力衰竭、糖尿病酮症酸中毒、高渗性昏迷、药物毒物中毒等。
近来该科又添置了呼吸机、除颤仪、监护仪、智能测定仪、注意力测定仪、微量血糖仪、远红外辐射抢救台、婴幼儿培养箱等设备。新生儿组具有独立病区，硬件设施齐备，抢救极低出生体重儿的成功率不断提高，许多新生儿缺氧缺血性脑病、新生儿肺炎、新生儿败血症、新生儿高胆红素血症、新生儿坏死性小肠结肠炎等均得到及时正确的治疗。
该科各专业组也成绩斐然，有3位白血病患儿在这里得到治愈；率先开展先心介入治疗等；建立“儿童哮喘之家”、“儿童多动症俱乐部”； 具有独立的儿科实验室，承担和完成多名研究生课题，目前开展的新项目有血降钙素原测定、病毒学检测、过敏原检测等，为临床诊断疾病提供有力依据。
儿科的护理部门理论基础扎实，操作熟练，服务温馨，她们个个都是“一针见血”的好手，在市区首家开展了床边“健康教育”，与患儿及家长在心灵上进一步沟通。
