本院解放前就开展了泌尿外科手术，1957年成立了泌尿外科专科，2003年被评为医院重点专科和广东省教育厅重点学科B类（与广州医学院联合申报），2005年被批准为国家药品临床研究基地专业科室，2006年被评为广州市医疗卫生机构重点专科，现拥有床位72张下设有两个病区，一个碎石室，一个尿流动力学检查室，一个男科诊疗室和一个实验室，拥有经皮肾镜输尿管镜、电切镜、体外冲击波碎石机、气压碎石机、激光碎石机、腹腔镜影像尿动力学检查仪、阴茎勃起监测仪、生物反馈治疗仪和C臂X光机等高级诊疗设备。
在余安迪（原广东省医学会泌尿外科学分会副主任委员）、王邦宏魏鸿蔼（现任广州市医学会泌尿外科学分会主任委员）、和王良圣等历届主任的带领下，本科室已发展成为开展项目齐全技术水平高又有专长的成熟学科。1984年在国内率先开展了经皮肾碎石取石术（PCNL），1985年开展了输尿管镜技术，1987年在中南地区率先开展了体外冲击波碎石术（ESWL），1988年在国内首创指探法在PCNL中的应用和PCNL与ESWL联合应用治疗肾多发性鹿角型结石，2001年华南地区率先开展骶神经调节治疗慢性排尿功能障碍无张力性阴道吊带术，治疗女性压力性尿失禁乙状结肠膀胱扩大术治疗神经原性膀胱和移植物注射压力性尿失禁。本科室在排尿功能障碍的临床技术（包括尿动力学检查技术神经泌尿外科学泌尿妇科学等）处于国内先进水平，主办了2期国家级继续医学教育项目《尿失禁学习班》和3期广东省省级继续医学教育项目《尿动力学学习班》，对功能性泌尿外科学在我国的普及和推广起到积极的作用。
全科有医师18名，其中博士生导师2名，主任医师5名，副主任医师6名。在“十五”期间取得了丰硕的科研成果，承担国家级课题（“863”子课题）1项，广东省自然科学基金2项，广东省科技计划项目6项，广州市科技局和广东省卫生厅项目3项，获广东省科技进步三等奖3项，广州市科技进步二等奖1项，三等奖2项。发表第一作者论著141篇，其中SCI收录5篇，中华医学系列杂志39篇，中国系列杂志31篇，省级杂志66篇，参编专业书籍6本。
