广州医学院附属市一人民医院消化内科是广东省特色专科和广州市重点管科，是这所具有超过百年历史医院的拳头学科。建国以来在姚碧澄、潘百思等老一辈知名专家的带领下，其临床和学术研究在国内、省内均享有一定知名度。近年李瑜元、聂玉强等专家先后接班后，不断强化学科建设、专科整体水平从临床（专科技术、就诊病人数、住院病人医疗指标等）及科教水平（论文、科技成果和科研课题立项数、博士、硕士研究生培养等）评估，一直名列全省前茅，形成了科研和临床齐飞共发展的局面。2002年消化内科被评为广州市重点专科及广东省特色专科。
消化内科附设消化病区（2个病区60张床位）、内镜中心、消化实验室、高强度聚焦超声肿瘤治疗中心等。现有教授、主任医师4人，副教授、副主任医师5人，讲师、主治医师人，博士导师1人，硕士导师5人，博士后1人，博士4人，硕士7人。在读博士后、博士、硕士研究生保持在18人以上。学科主任李瑜元教授是广东省“五个一科技兴医”学术带头人，广东省“五一”劳动奖章获得者，享受国务院政府特殊津贴。技术力量雄厚，人才梯队合理，有效地保证了医疗质量。
拥有放大电子胃、肠镜、电子十二指肠镜、双球囊推进式电子小肠镜、彩色多普勒超声内镜、氩气刀、胃食管PH测定仪、胃肠测压仪、14C幽门螺杆菌呼吸诊断仪、体外腹部彩色超声、C臂X光机、高强度聚焦超声肿瘤治疗系统（HIFU）、多极射频消融肿瘤治疗仪、光动力肿瘤治疗仪、荧光定量PCR仪等先进仪器设备，使患者能享受到先进、准确、有效的诊疗措施。
除常规胃、结肠镜检查外，还开展了无痛和全麻胃镜、结肠镜、小肠镜、超声内镜检查，显著提高了消化道疾病诊断的准确性。各种内镜下治疗术也得到广泛应用，包括：溃疡出血注射止血术，食道静脉曲张套扎及硬化剂注射止血术，息肉及早期肿瘤电切术，逆行胰胆管造影（ERCP）并胆总管切开取石术，贲门、幽门狭窄球囊扩张术，食道、胆道狭窄内支架放置术，胃造瘘术等，并有高强度聚焦超声（HIFU）肿瘤治疗系统和多极射频肿瘤消融仪治疗癌，病例数及诊疗技术均居全省领先水平。
80年代在国内领先开展胃幽门螺杆菌（HP）感染的基础和临床研究，其中“幽门螺杆菌感染最佳根治方案选择”获卫生部十年百项推广项目，并对亚临床肝性脑病发病率及功能性胃肠病与精神心理因素关系等进行了系统、深入的研究，并依此进行了干预治疗，均取得了满意疗效。
近年共获得国家、省、市科技进步奖17项，并有肝癌序贯治疗的最佳方案选择，基因多态性和药物疗效关系，干细胞移植治疗炎症性肠病等10余项省、市级重点科技攻关项目立项目前在研究中。获得资助700万元。每年中标省市科研课题2-3项发表论文20篇左右。
