郴州肛肠病治疗中心为全市开设最早功能最全的科室，现设在郴州市中医院。现有床位30张，医务人员15人，其中高年资主治医师5人；电脑肛肠治疗仪1台，同时医院拥有进口肠镜、彩超及CT等先进设备。目前运用中西结合优势开展痔瘘病、便秘、炎性肠病、大肠肿瘤及肛门皮肤性疾病等诊疗业务。
1.对内痔、外痔、混合痔、肛周脓肿、肛裂、肛瘘、脱肛等分别可采取药物、注射、电疗、手术等多种方法治疗。运用分段齿形结扎术及对复杂性肛瘘采取切除、旷量、脱管及缝合等综合性治疗，为市内首创省内先进技术，具有痛苦小、疗效可靠、不住院或住院期短等优点。
2.对各种便秘采用药物治疗的同时，率先在省内开展注射术及外科手术治疗新技术。2000年9月从上海第二军医大学附属长海医院引进的结肠传输试验，排粪造影等便秘检查项目及对慢转输、出口梗阻型便秘的外科治疗，填补了省内空白。
3.采取中西药内服，保留灌肠治疗，炎性肠病。对慢性结肠炎、溃疡性结肠炎已取得可靠疗效。
4.对大肠肿瘤病以外科手术治疗为主要手段，配合西药化疗，中药调节治疗，可达到根治、延长生存、提高生活质量的目的。
肛门皮肤性疾病：采用手术、药物、注射等方法治疗，可治疗肛门湿疹、皮肤瘙痒、尖锐湿疣等肛门疾病。
