肛肠（痔瘘）科成立于1977年，是国家级重点中医肛肠专科建设单位。
科室对治疗低位单纯性肛瘘、低位复杂性肛瘘、高位单纯性肛瘘、高位复杂性肛瘘、内痔、外痔、混合痔、肛管皮肤环形缺损、肛门瘙痒症、直肠前突、直肠前壁粘膜脱垂、直肠粘膜内套叠、耻直肌肥厚、耻直肌痉挛、肛门内括约肌痉挛、直肠息肉等肛肠疾病，具有很大优势。2001年科室率先在临沂市开展排粪造影、结肠传输试验等Ｘ线检查项目，开展了慢性便秘的动力形态学诊断及手术治疗，如直肠前突修补术、直肠粘膜内套叠切除术、直肠前壁粘膜脱垂切除术、耻直肌痉挛挂线切断术、耻直肌肥厚部分切断术等。
科室自行研制的专科制剂具有疗效好、费用低、作用独特的优势，主要有：(1) 双功调肠丸，用于初头性便秘患者；(2) 消坠合剂，用于术后病人肛门坠胀；(3) 肿痛消洗剂，对水肿及疼痛等术后并发症有确切疗效；(4) 红粉油膏，用于术后病人换药等。
