上海交通大学医学院新华医院病理科是由成人外科病理和小儿外科病理为主体，肾活检病理，骨髓病理，细胞学病理，分子生物学病理及免疫组织化学病理等多种分支病理为辅所组成的一个综合性临床病理科室。几十年来在医院领导的关心和临床部门的支持以及全体医生和技术员的努力下，科室取得了一定的发展。病理科现有医师6名，技术员6人，其中教授3名，副教授1名。病理科的年外检量达1，800多人次。
现任病理科主任姚晓虹教授，医学博士，硕士生导师。从事临床病理工作25年。曾于90年代留学日本7年，毕业于日本京都府立医科大学研究生院。并曾在日本京都府立医科大学附属医院的病理检查部和日本滋贺国立医科大学病理学第一教研室工作。发表论文20余篇 ，编写学术专著2部。自从2005年下半年起负责医学院的病理读片会以后，参加单位由原来的8家发展到近30家医院，人数达600多人次。病理读片会为上海市临床病理医师的继续教育和提高临床病理诊断水平所做的工作得到广大病理医师的好评。
病理科在小儿先天性巨结肠黏膜活检的诊断等方面多年来一直保持着自己的特色。在消化科胃镜室的密切合作下，近年来胃癌的早期诊断率有了显著地提高，一些疑难杂症如胃恶性淋巴瘤，嗜酸细胞性胃炎及其它如急性白血病等诊断和鉴别诊断方面亦有独到之处。此外，病理科还还担任一些上海市内外的疑难病理切片的会诊。
该科在小儿先天性巨结肠的诊断方面协助临床做了大量的工作，并多次获奖，水平在国内居领先地位。在成人子宫促性腺激素释放激素受体测定，前列腺癌5α-还原酶的测定，胃幽门弯曲菌的毒力基因检测，胃印戒细胞癌的细胞凋亡的研究；在儿童实体肿瘤各方面的研究，儿童纤维腺瘤的ER，PR和ACTH激素的测定以及儿童骨髓嗜血细胞综合症等研究也有所突破。多年来一直协助临床科室的科研和研究生课题做了大量的工作，协助带教一大批临床医学博士和硕士研究生。其中不少的课题取得了良好的成绩。近些年来，病理科在各级学术期刊上发表论文近30篇。
该科室的学科建设以工作带动人才培养，并以实践中提高为主，引进和培养并重。在科主任的带领下，科技创新，努力工作，积极开展新技术，新业务，拓展新的技术领域。为建设一支科研和医疗技术都过硬的病理科而努力奋斗。
