心内科隶属于大内科，1979年成立了单独的心脏监护病房（CCU病房，拥有床位5张），1999年三级分科，使心脏病的诊疗专科化。至今已发展成为拥有9名专业医师，30张床位，集科教研临床诊疗为一体的综合学科，2003年当选闵行区心血管内科特色专科。
心内科在五院独立成科较晚，但它在内科中的地位不容忽视，从上世纪50年代的郭守蔚主任、70年代的禹宝莲主任、卜国强主任、金松元主任、80-90年代的张祖茂主任，在上海西南地区都享有很高的医学地位，并曾聘请了全国著名心血管病专家浦寿月教授、何梅先教授作为技术顾问全面指导业务，吸引了各地的患者慕名前来就诊。尤其是2002年来通过引进人才和培养人才，在现今科室负责人许澎，副主任伍旭升的带领下，狠抓规范化的诊疗，使心内科的整体业务素质，诊疗水平得到大幅度的提高，同时开展了多项新技术新业务，诊疗患者数目成倍增长，危重症患者抢救成功率达95%以上，现已成为上海市西南地区规模较大、设备齐全、技术力量很强的科室，已赢得了社会的好评，在上海市心血管界也享有一定的地位。
目前心内科设有CCU病房，普通病房，心导管室，无创功能检查室，心电图室等，拥有心脏科专业医师9名，其中副主任医生3人、主治医生3人、住院医生3人，硕士及在职硕士研究生5人、并有西门子数字化心血管造影机（DSA）、计算机化多导心电生理记录仪（BARD）、惠普多中心心电监护系统等先进设备。年收治病人500余人次，门诊5000余人次，各种手术200余台。
