该科早在1978年开展胃、肠镜检查工作，经过几十年医务人员的不懈努力，现已发展成为技术力量雄厚、设备功能先进的科室，享有较高声誉。
科室现有奥林巴斯240型电子胃镜（日本）、 奥林巴斯240型电子结肠镜（日本）、奥林巴斯十二指肠镜（日本）、爱博高频电刀（德国）等先进设备，能为病友提供更全面、多方位的内镜诊断和治疗项目。科室配有专职主任医师、主治医师等医护人员多名。医护人员均经过广州南方医院及上海东方肝胆医院进修培训，具有扎实的理论基础知识和娴熟的内镜操作技术以及丰富的临床实践经验；具有良好的敬业精神和团队精神；具有高度的责任感和服务意识。
目前，科室除开展常规电子胃、结肠镜、十二指肠镜检查以外，还可开展染色内镜检查及无痛胃、结肠镜检查；食管静脉曲张内镜下硬化剂注射和套扎治疗；急性消化道出血内镜下止血治疗；食管癌、食管狭窄内镜下扩张和支架置放治疗；内镜下逆行胰胆管造影和乳头肌切开取石术及胰胆管支架置入术；内镜下消化道息肉电切术；消化道异物及蛔虫取出术；胃内结石碎石及取出术等。
多年来，开展了十多项新技术项目，其中获赣州市科技局科技进步奖多次，获赣州市卫生局新技术项目多项。在国家、省、市级医学刊物上和专业学术会议上发表论文20余篇。
