小儿外科成立于1981年，是我院创始科室之一，当时床位15张，专科医师5名。现已发展成为有专科病床38张，目前有在岗工作的教授(主任医师)3人，其中硕士生导师2名，副教授(副主任医师)5名，每年完成小儿外科手术约2，000余例，年门诊量20，000余人次，是浙南地区的小儿外科疾病临床诊治中心。目前是浙江省医学会小儿外科分会主任委员单位。温州医学院党委副书记陈肖鸣教授、现任科主任李仲荣教授是该学科的学科带头人。
小儿外科收治14岁以下小儿的外科疾病。从1981年创立以来，小儿外科逐渐形成了小儿普外，小儿泌尿，小儿肿瘤，新生儿外科等专业组(小儿心胸外科、小儿骨科另独立设科)，诊治水平有了极大的提高。我科在努力提高治愈率的同时，还注重功能恢复和美容效果的改善。除开展斜疝，鞘膜积液，隐睾等儿外常见病治疗外，经肛门巨结肠根治手术，pena术治疗先天性肛门闭锁， 先天性胆道闭锁肝门空肠Roux-Y吻合术，环状胰腺十二指肠十二指肠侧侧吻合术，离断式肾盂输尿管成形术等均已是我科常见的手术方法，并取得了肯定的疗效；同时对手术技术不断的进行了创新，减少了术后并发症。另外，还开展巨大腹部肿块及腔静脉瘤栓切除术，肾上腺嗜络细胞瘤切除术，巨型腹裂和脐膨出修补术，肝肿瘤切除术，后尿道狭窄成行术，先天性尿道下裂成形术等手术，均取得了较好的疗效。此外，小儿外科还开展了小儿膀胱镜检查,小儿腹腔镜手术，上消化道功能检测和肛门直肠动力学检查等新技术。小儿微创手术是我们今后的发展方向，包括腹腔镜手术等各种内窥镜手术、小切口或切口美观、隐蔽的手术等，一切为方便病人，减少患儿痛苦，加快术后康复，缩短住院时间，较少费用。我们将以优质、热情的服务和精湛的医术欢迎患者前来就诊。
目前我科为温州医学院重点建设学科，医院重点建设学科，2007年小儿普通外科学被评为浙江省医学重点扶持建设学科。近五年来承担省部级研究项目6项，厅局级研究课题10余项及多项院内研究课题。承担着温州医学院临床医学儿科专业方向小儿外科本科教学工作；2001年起招收硕士研究生，具有硕士学位授予权，目前已招收硕士研究生15名，毕业硕士研究生7名。2006年小儿外科还成功地通过了国家卫生部专科医师培训试点基地的评审。
