本院的产前诊断中心组建于2003年5月，由遗传咨询门诊、遗传实验室、生化免疫室和B超室组成，设有产前诊断会诊中心，2006年4月通过上海市卫生局和卫生监督所审核，正式成为上海市四家产前诊断中心之一。
国际和平妇幼保健院的产前诊断中心由2名从事遗传咨询的主任医师、5名妇产科主任和副主任医师、1名儿科主任医师、2名医学影像学主任和副主任医师、1名检验科副主任技师和7名中级职称的医技人员以及其他相关人员组成。
一、 遗传咨询门诊
自1978年10月开办至今接待来自全国各地的夫妇，开展遗传咨询和产前诊断工作，每年接待咨询者3000余人。
遗传门诊的医务人员具有较好的遗传咨询知识，对常见遗传病的临床表现、一般进程、预后、遗传方式、遗传风险、再发风险;常见的致畸因素、致畸原理及预防措施;常见遗传病和先天畸形的检测方法，各种诊断技术的意义、有效性、风险率、时限性和局限性、可能结局等，给予正确指导分析，并提出医疗处理的建议。
二、 遗传实验室
自1977年5月建立以来接待来自全国各地的病员，是全国最早通过羊水进行产前诊断的两所医院之一，每年接待病员数千人。主要进行细胞遗传学和分子遗传学的检测，例如：开展孕期胎儿羊水细胞、绒毛细胞和脐带血细胞的染色体核型分析及基因检测，近30年来已作羊水细胞培养胎儿染色体核型分析数千例。
现有主治医师和住院医师各一名(均为硕士)，主管技师3名(其中硕士1名)，技师3名，具有很强的的技术力量，羊水细胞培养成功率达96%以上，采用G带及其他显带法使羊水染色体和外周血染色体核型分析准确率达100%。
三、 生化免疫室
自2002年1月起，通过对孕妇血清三联的检测，开展21-三体综合症和神经管缺陷的产前筛查工作。5年来已对20000名孕妇作了筛查，年服务量可达5000例以上。
现有副主任技师1名，主管技师2名，技师2名。采用全自动免疫检测仪，筛查阳性率5%左右，筛查出胎儿21-三体综合症9例，DOWN’S检出率达64%以上。同时还筛查出18-三体综合症3例，其他染色体异常5例。
孕妇血清学筛查适宜时间为孕14-21周。
四、 B超室
通过超声波对胎儿作生长发育的评估、畸形筛查和产前诊断，每年除了为本院数千名孕妇作以上检查外，还接受上海和全国各地转诊的疑难病人数千例。
现有主任医师1名，副主任医师1名，主治医师和住院医师14名，该科主任医师不仅在B超诊断技术方面具有丰富的临床经验，发表相关论文十余篇，而且工作作风严谨，带领全科人员发现问题，留下图像做好记录，跟踪新生儿或引产胎儿进行核实，大大提高了宫内胎儿畸形的诊断水平。从80年代起，发现神经系统等十大类胎儿异常数千例。目前最早发现胎儿异常时间为孕13周。
胎儿畸形筛查的适宜时间为孕18-24周，(需提前预约)。
五、 产前诊断会诊中心
产前诊断会诊中心成立于2004年9月，由2名从事遗传咨询主任医师，3名妇产科主任和副主任医师，1名儿科主任医师，3名医学影像学主任和副主任医师和1名主治医师组成。每周由其中三名临床医师和2名医学影像学医师进行一次会诊。目前已为600余名孕妇作了产前诊断。
