复旦儿科医院心血管中心是在著名小儿心血管专家宁寿葆、张善通教授倡导下建立的国内最早的小儿心血管内外科融为一体的特色科室。经过十余年的学科建设，已经成为国内驰名的小儿心脏中心。目前中心拥有专业医务人员50余名，其中教授、副教授15名 具有博士学位的医生占专科医生总数40%，硕士学位占40%，博士生导师5名。承担国家自然科学基金、教育部、卫生部、上海市等重要科研项目30余项 培养小儿心血管专科进修医生100余名，研究生70余名 目前每年施行各类心脏外科手术近700例 心导管造影介入200余例、超声心动图检测10000余例、动态心电图和运动平板试验1000余例。每年在各类国内外专业杂志发表论文40余篇，共编写《先天性心脏病》、《现代实用儿科学》、《小儿心胸外科学》和《小儿临床超声诊断学》等专著20余部。曾获国家级、省部级科技进步二、三等奖9项。另外，每年举办卫生部继续教育项目“全国先天性心脏病诊断治疗学习班”和“全国小儿超声心动图临床应用学习班”。
复旦儿科医院心内科专业已有四十余年历史，在心血管疾病的诊治方面积累了丰富的经验。五十年代中期，在国内首先开展心导管检查和心血管造影，八十年代初，在国内较早开展彩色多普勒超声诊断心血管疾病的工作，大大提高了先天性心脏病和其他心血管疾病的诊断水平。拥有彩色多普勒心超仪、电影造影仪等大型设备，开展先天性心脏病的诊断及介入治疗3000余例，并具有心电图、24小时动态心电图、小儿心功能平板等较全面的小儿心功能检测系统。对病毒性心肌炎、风湿热、川崎病、心肌病、各类心律失常等小儿心血管疾病的诊治在国内享有较高知名度。学科带头人桂永浩教授现任为中华医学会儿科学会副主任委员。
复旦儿科医院心胸外科为我国最早建立的小儿心胸外科专业之一。近30年来，在学科建设、人才培养和社会服务方面都有长足的发展。对各类先天性心脏病的治疗积累了丰富的临床经验，尤其对新生儿、婴幼儿复杂先天性心脏病取得了突破性进展，如新生儿、早产儿完全性大动脉错位的动脉调转术，完全性肺静脉异位引流、房室共道纠治手术，各类姑息性的体－肺分流术、肺动脉环缩手术、腔肺分流术等，还有体外循环中含血心肌保护、改良超滤技术的应用。手术成功率达99.3%。此外，还对1000余例胸部疾病进行有效的手术治疗 近年开展的微创心脏手术，效果良好，广受病家欢迎。
