经过几年来的人才引进和选送优秀医生去上海三级甲等医院进修培养，市三院内科的人才梯队建设逐步完善。临床医师中，有高级职称4人，中级职称5人，高年资住院医师7人。住院病区设在新病房大楼的五楼，拥有舒适的病房设施和现代化医疗硬件的配置。
近几年，我院内科设立了心血管内科、神经内科、消化内科、呼吸内科四个三级学科。心血管内科主要治疗各种心脏病、心肌病、高血压病、高血脂症。先后成功抢救了机型心肌梗死合并重度支气管哮喘、扩张型心肌病并发心力衰竭等患者。对心血管疾病的诊断，治疗疑难心血管疾病的综合处理，及急诊抢救等具有丰富的临床经验。
神经内科以治疗各种头痛、癫痫，以走路不稳、震颤为主的帕金森症，以偏瘫、失语、手足麻木等为临床症状的脑血管疾病等。临床开辟了静脉溶栓治疗脑梗塞、脑大池引流治疗蛛网膜出血等。
消化内科是全市唯一指定的由血吸虫感染引起的结肠炎、肝硬化治疗的专科，由昆山著名肝病专家王德威主任担任主治医师。科室对治疗消化道溃疡、各种胃炎、肝硬化、消化道肿瘤、胰腺疾病、炎症性肠病等有丰富的临床经验。所属的胃肠镜从86年至今有二十年历史，不但开展无痛胃肠镜检查，还开展内镜下治疗，年胃肠镜检查4000余人。并请苏大附一院病理科医生合作进行病理诊断。
呼吸内科对肺炎、慢性阻塞性肺疾病、慢性肺心病、支气管哮喘等常见病能准确诊断及正确处理。能通过CT、纤维支镜等检查及经皮肺穿刺活检等技术及时诊断肺部肿块、对支气管哮喘及慢性咳嗽患者进行科学、规范化管理、开展了综合疗法救治大咯血、有创及无创器械通气治疗呼吸衰竭、静脉溶栓救治肺血栓栓塞症，经皮置管闭式引流治疗气胸等技术取得良好效果。
