市三院外科有医生17人，其中正高2人，副高3人，主治5人。全科医生均为本科以上学历。外科病区设在新病房大楼8楼，具有人流、物流、信息流管理系统和中心给氧、中心吸引、电视监控、电脑联网、VIP病房等硬件设施。每个病房配有卫生间、淋浴室、电视机、中央空调等。 手术室在新大楼10楼，拥有最先进的空气净化层流系统，达到国家级手术室标准。
近年来，在昆山市外科学科带头人、副院长钱呈兴主任医师的带领下，不断发展壮大，设立了普外、脑外、泌外三个二级学科。目前普外科开展的手术有肝部分切除术、外伤性肝破裂修补术，脾切除术、乳腺癌根治术、甲状腺次全或全切除术、胆囊胆道手术、胃癌根治术、大肠癌根治术、急性重症胰腺炎手术、肠梗阻手术、大隐静脉曲张手术、内、外痔手术、肛裂肛瘘、阑尾疝气等绝大多数常规手术。科室注重微创手术的发展，开展了直视下微创胆囊切除术和腹腔镜胆囊切除术。与上海三甲医院专家挂钩成功开展肺、食道肿瘤手术等。对腹部危重多发伤、复合伤伴休克患者抢救成功率95以上。门诊小手术随到随做。
脑外科开展颅脑外伤急性脑出血、脑积水分流术、脑室穿刺引流术、慢性、亚急性硬膜下钻孔引流术、骨修补术、颅脑外伤、高血压脑出血微创钻孔引流手术、颅脑凸面肿瘤如脑膜瘤胶质瘤等手术，成功抢救多例脑外伤危重患者。
泌尿外科开展了前列腺切除术、输尿管、肾、膀胱结石手术、肾、膀胱部分切除术、包皮环切术、精索静脉曲张手术、睾丸鞘膜积液等手术。
