上海交通大学医学院附属第九人民医院眼科是上海市重点学科。是以眼整形眼眶外科为特色，白内障、青光眼、斜弱视、玻璃体视网膜病、眼视光学等各专业俱全的综合性学科。眼整形眼眶外科又分为眼部美容、眼睑疾病、泪道疾病、眼眶疾病和眼肿瘤等研究方向和特色亚专业。 眼科拥有医护人员42人，开放床位数达62张，拥有病房手术室4间和门诊手术室5间。拥有独立的眼科实验室。每年住院患者人数达到3000余人，年完成门诊和病房手术近万余台。
