脊髓神经外科
位置：神经外科一病区(住院楼9层)
擅长治疗脊柱脊髓疾病的一流专科。具有现代化诊疗设备，如磁共振、螺旋CT、DSA、手术显微镜、脊柱导航仪、高速磨钻、术中神经监测仪、细胞生物实验室等。医院重点科室，同时是清华大学博士后流动站。依托清华大学强大科研实力，脊髓神经外科融合了神经外科、显微外科和脊柱外科的优势，在脊柱脊髓损伤、脊髓肿瘤、颈椎病、椎间盘突出、骶管囊肿等脊髓疾病的诊治方面具有较高的水平，尤其是在脊椎裂、脊髓脊膜膨出、脊髓拴系综合征的诊治方面更具特色。在治疗先天性疾病方面，现年手术量近400例，共完成1300余例，手术例数已经达到全国最多，手术疗效在全国处于领先地位。
主任修波，副主任崔志强都是从事神经外科工作20余年，拥有丰富的脊髓外科经验和高超的显微手术技术水平。学科汇集了众多国内外医学博士、硕士，有从事基础和临床等各种领域的人才。该科还聘请了神经外科和脊柱外科的权威专家担任技术顾问，包括中华神经外科学会候任主任委员、解放军301医院神经外科主任、博士生导师周定标教授，协和医院脊柱外科专家、博士生导师叶启彬教授及国外大学著名教授。
该科室目前已经成为我院经济效益和社会效益较好的科室之一，年收入以每年20%左右的速度递增，相信科室在院领导的关怀支持下会走向更大的辉煌。
功能及微创神经外科
位置：神经外科二病区(住院楼11层)
成立于2005年3月，科室主任陈国强主任医师。下设内镜神经外科、立体定向与功能神经外科及脑血管病三个临床专业组，共有医护人员40人，其中主任医师2人，副主任医师3人，博士研究生5人，硕士研究生3人，在读硕士研究生1人，五年共计完成手术5000余例，年平均手术逾千例，多项技术居国内领先水平，病人来源覆盖了除台湾、澳门及西藏以外的31个省、市、自治区，另有部分外蒙古及其他海外患者慕名前来就医。
国内领先技术有：
1、显微血管减压术治疗面肌痉挛、三叉神经痛、舌咽神经痛，目前已实现流程化、规范化管理，手术疗效大大提高，并发症发生率显著下降，每年治疗此类患者超过800例;2、脑积水的个性化治疗：在国内率先开展神经内镜手术，特别是采用软性内镜治疗脑室脑池疾病。多项内镜下手术填补国内空白，达到国际先进水平，如内镜下导水管成形或支架植入术、内镜下后颅窝囊肿造瘘术、内镜下经导水管第四脑室内囊虫取出术、第四脑室出口堵塞造瘘术等，至2009年底已治疗各种脑积水患者600余例。在世界上首创神经内镜下钻孔冲洗术治疗老年慢性硬膜下血肿(不放置引流);3、立体定向下脑功能区及脑深部肿瘤和其它病灶微创切除术;4、神经内镜下经单鼻孔微创切除垂体瘤、视神经减压及脑脊液漏修补等;5、手术根治偏头痛。
特色医疗服务有：
1、痉挛性斜颈、扭转痉挛的手术治疗;2、癫痫外科治疗;3、手术治疗顽固性疼痛;4、采用神经核团毁损、深部电刺激、细胞移植等技术治疗帕金森病;5、锁孔微创手术切除听神经瘤、桥小脑角区胆脂瘤、鞍区肿瘤及脑动脉瘤夹闭;6、手术治疗严重精神病及神经症;7、其它各种立体定向术(如高血压脑出血血肿穿刺抽吸、脑脓肿、囊肿穿刺等)。
脑瘫及周围神经外科
位置：神经外科三病区(住院楼8层)
神外三病区是集手术、康复和电生理于一体的脑瘫及周围神经疾病专业治疗科室。由著名的神经外科专家王世杰(留日博士)主任领衔，于2003年回国组建科室，坚持综合化、个性化治疗理念，对脑瘫患者进行全方位、系统化的评估和治疗，使手术、电生理与康复训练相结合。在国内率先引进周围神经缩窄术治疗肢体痉挛症状，并与选择性脊髓后根切断术( SPR )相结合，最大程度减少了术后并发症，极大地提高了治疗效果。目前已行手术治疗近3000余例，有效率95%以上。科室设有专门的康复训练室，为术后患者进行围手术期的康复治疗，具有专业的康复医师进行训练指导。最新引进芬兰ME6000表面肌电分析系统，对患者术前和术后进行肌力、肌张力测定、关节活动度测量和步态分析，定量、客观地评估患者痉挛和运动功能障碍的严重程度，为制定手术和康复治疗方案提供依据，同时还可以量化手术和康复疗效，大大提高了手术的精确度。
