感染性疾病科是永康市唯一收治病毒性肝炎、结核病及其他各种感染性疾病的重点科室。同时还担负全市突发公共卫生事件处置工作的保障任务。设有住院部、发热门诊、肠道门诊、感染病普通门诊、肝病专家、专科门诊、结核专家门诊、脂肪肝专家门诊。现有医护人员共23名，其中医师9人，护士14人。副高以上职称5人，中级职称5人，初级职称13人。
医院经总体搬迁后，新的感染性疾病科总建筑面积达5090㎡，门诊和住院部连为一体，位于医院的一角，毗邻医院的网球场和篮球场，四周有各种花草树木，苍翠的竹子，环境堪称一绝。病室配备齐全，舒适宜人。设有固定床位46张，但必要时可开放床位60张。三楼为备用病房，供收治需严密隔离的传染病人用，目前已为永康市出现的突发公共卫生事件作出贡献。
本科近年来经过积极选送高年资医师到浙一医、上海肺科医院进修，技术水平和技术力量不断增强，科室在诊治水平上有了长足的进展，尤其在以下几个方面形成了其明显的专长和特色：1、各种发热性、出疹性疾病的诊断、鉴别诊断及治疗；2、慢性咳嗽的成因的鉴别；3、常见及少见传染病的筛查及治疗；4、夏秋季腹泻病的处置；5、各种急慢性肝炎及肝硬化、脂肪肝等的诊治；6、重症肝炎、肝衰竭患者的救治；7、各种肺结核及肺外结核病人的诊治；8、重症、耐药结核病人的救治；9、肺结核和其他肺部疾病的鉴别诊断；10、胸、腹水成因的鉴别；11、目前还开设了获得性免疫缺陷综合征（艾滋病）的检测和咨询门诊。目前已开展：腹水超滤浓缩回输治疗顽固性肝硬化腹水；肝穿刺肝细胞组织活检术和免疫组化；ａ-干扰素、核苷（酸）类似物治疗慢性乙型肝炎；肝炎肝硬化患者的核苷（酸）类似物的抗病毒治疗及抗肝纤维化治疗；ａ-干扰素加病毒唑治疗丙型肝炎；乙肝病毒载量的检测；乙肝病毒耐药的监测及耐药基因的监测；人工肝治疗重症肝炎、胆汁淤积性肝炎；结核性胸膜炎或腹膜炎的胸/腹腔置管引流术；结核性脓胸的胸腔冲洗注药治疗；胸膜活检术及肺穿刺活检术；并充分运用祖国医学的魅力，开展中西医联合治疗各类传染病。
