针灸科是宣武中医院门诊量最大的科室，集医疗、教学、科研三位于一体，门诊有13个诊室，60张治疗床。现有主任医师2名，副主任医师3名，主治医师3名，硕士、博士5名。日均 门诊量达500多人次。经治病症上百种，在内、外、妇、儿、骨伤、五官、皮肤等科的常见病及多种疑难病证的治疗上，采用传统针灸、中药等治疗手段，收到良好的治疗效果。针灸科承担了北京中医药大学中医系的针灸学授课任务，有2名兼职教授；是北京国际针灸培训中心的临床实习基地之一；每年接待大量的中、外针灸实习生、进修生和社区医生。针灸科已有多名专家出国援外、讲学和工作，能用英语、法语和日语接待外宾患者。近年来，针灸科努力提高医生的医疗技术，开展多项针灸疗法，疗效和知名度不断提高，门诊量不断增多，2次被区卫生局评为先进集体。
针灸科门诊擅长治疗中风、面瘫、面肌痉挛、关节痛、头痛、三叉神经痛、眩晕、失眠、胃病、呃逆、呕吐、颈椎病、落枕、肩周炎、网球肘、腰椎病、坐骨神经痛、椎间盘膨出、哮喘、咳嗽、便秘、遗尿、尿失禁、阳痿、早泄、月经不调、痛经、更年期综合征、不孕、胎位不正、产后乳少、粉刺、带状泡疹、慢性湿疹、慢性寻麻疹、神经性皮炎、各种周围性神经炎、耳鸣、耳聋、鼻炎、小儿假性近视、小儿脑瘫、斜视、弱视、冠心病、癔病、肥胖症等。
针灸科常用的方法有：毫针、芒针、艾灸、拔罐、三棱针刺血、穴位注射、穴位敷帖、穴位照射、火针、电针、耳针、耳穴压豆、穴位埋线、头皮针、梅花针、中药等。
宣武中医院针灸科的特色疗法有：火针、穴位注射治疗疑难杂症，耳穴割治用于面部美容，淋巴结刺激疗法治疗各类炎症及耳鸣、耳聋，穴位埋线治疗肥胖症等。
