第三军医大学西南医院肝胆外科创建于1963年，是中国胆道和肝脏外科学的发祥地，也是国际上最早建立的以肝胆胰外科疾病防治研究为主要内容的专科，创始人为国际著名外科学家黄志强院士。在老一辈专家的卓越领导下，经过几代人的艰苦创业，学科不断发展壮大，现已成为解放军西南肝胆外科医院、全军肝胆外科研究所、首批全军临床医学“重中之重”建设学科、全国高校重点学科、全军重点实验室;是肝胆外科领域内集科技创新、复杂疑难病诊治及高层次专业人才培养为一体的，国内外规模最大并享有盛誉的肝胆胰外科中心之一。
顺应国际外科学的发展趋势，围绕学科建设目标，扩展规模优化结构，在强化胆道外科学术优势的基础上，实施亚专业发展战略，现开展床位160张，已建成由3个肝胆胰病区、1个肝移植病区组成的疑难重症疾病诊治中心;建成符合国际规范的临床研究中心和以肝移植、肝脏外科及胆道外科病理生理主要问题研究为特色的全军肝胆外科重点实验室，促进了以临床需求为牵引的创新发展战略的实施。承办了中华医学会系列杂志—《中华消化外科杂志》，开辟了消化外科领域学术交流的新园地。
以创建国际一流的肝胆外科中心为目标，实施国际化人才发展战略，重点培养和引进优秀中青年技术骨干，形成了临床外科和实验外科两支密切结合的专家队伍;充分发挥资深专家的学术指导和学风传承作用，倾力造就杰出的中青年学科学术带头人，为我国肝胆外科事业的蓬勃发展奠定了坚实基础。
“十五”期间，获得一批创新性科技成果，国内外学术地位和学术影响显著提升。先后承担了国家杰出青年基金1项，军队杰出青年基金1项，国家自然科学基金项目14项，全军及重庆市医学攻关项目10项;获得国家科技进步一等奖1项，国家发明奖1项，军队科技进步一等奖1项，军队医疗成果一等奖1项，军队科技进步二等奖8项，军队医疗成果二等奖6项，重庆市科技进步一等奖1项。共主(承)办国际、国内学术会议6届，其中主办的“中国国际肝胆外科论坛”已成为展示国际肝胆外科学最新进展和演绎外科大师精湛医术的高水平学术盛会。聘请了国际肝移植协会主席John Fung教授、欧洲外科学会主席Bismuth教授等10名国际著名外科专家为本学科名誉/客座教授。
新世纪的西南肝胆人传承着济世活人的仁爱精神、严谨求是的科学精神、精益求精的敬业精神、敢为人先的创新精神和同心奋勉的团队精神，纳四海之贤士，聚凌云之壮志，自强不息、开拓进取，卧薪尝胆，走向世界。在过去四十年辉煌成就的坚实基础上将肝胆外科事业不断推向新的高峰，为创建具有国际一流水平的肝胆外科而努力奋斗。
